Mitochondrien sind sogenannte Zellorganellen von Zellen. Sie sind von Doppelmembran umgeben und verfügen über eine eigene DNA. Sie erfüllen eine Reihe wichtiger Aufgaben in der Zelle besonders bei der Regeneration von Adenosintriphosphat (ATP), welches in der Zelle zur Energiegewinnung verbrannt (Oxidation) wird. Sie werden von den Vertretern der Mitochondrialen Medizin als Energiekraftwerke der Zelle bezeichnet. Die ideologischen Grundlagen der Mitochondrialen Medizin besagen, dass durch eine Vielzahl negativer Einflussfaktoren die Funktion der Mitochondrien gestört werden kann, was dann zu vielen verschiedenen Krankheiten und Störungen führen soll. Störende Faktoren können psychischer Stress, ungesunde Ernährung, Mangel an Mikronährstoffen, Freie Radikale und andere sein. Therapeutisch werden diese vermeintlichen Fehlfunktionen der Mitochondrien mittels Ernährungstherapie, der Orthomolekularen Therapie und der Mikrobiologischen Therapie behandelt.